直航每週新增100班 華航、長榮各21班、復興8班
民航局表示，此次經過兩岸民航協議，兩岸直航客運班次將增加37％，並增加台中、花蓮、台東及馬公等4航點的觀光旅遊包機，若包含不定期旅遊包機則客運增加比例則可達到41％。應可紓解目前北京、上海及深圳等航點一票難求問題；貨運總班次增加比率則約71％。此外，民航局也向對岸爭取提供給台籍航空較好的飛航時間，大陸也回應，特別是虹橋機場核准的台籍航空飛航時間帶會讓人滿意。
松山—虹橋每週飛14班
經過此次協議，雙方除同意新增虹橋、石家莊2個客運航點，虹橋限定與松山對飛，每週14班。松山—虹橋方面，雙方同意各可指定2～3家航空公司，自6╱14起以定期航班方式飛航每日2班，雙方合計每日4班。其中華航及長榮各飛航每週6班，復興飛航每週2班，合計共14班。
深圳、北京增為每週14班
深圳增加4班後，總計為每週14班，將由華航及立榮各飛航桃園—深圳每週5班，另由華航飛航高雄—深圳每週2班，立榮飛航台中—深圳每週2班。北京增加4班後，總計為每週14班，由華航及長榮各飛航桃園—北京每週7班。未來2家航空公司均可天天由桃園直飛北京，增加旅客搭乘便利性。
至於其他每週28班，則華航及華信合計使用11班、長榮及立榮合計使用11班、復興航空使用6班。其中每週20班必須用於廈門或福州航點。另外，雙方也同意除定期航班之外，各可在台中、花蓮、台東及馬公等航點飛航不定期旅遊包機，每月最多不超過20班。
另因兩岸總班次由每週135班增至185班，民航局也已協調民航業者將高雄出發的兩岸航班由現行每週16班增加為24班；台中出發的兩岸航班也將由每週10班增為18班。
貨運新增4航點共20班
貨運方面，雙方同意增加南京、廈門、福州、重慶等4個航點，兩岸各增加10班，合計增加每週20班，由每週28班增為每週48班，除4個新航點各飛每週2班之外，上海、廣州各增加每週1班。新增的每週10班，由目前擁有貨運機隊的華航及長榮各分得每週5班。
雙方可共用班號
雙方此次除了增加客貨運航點及航班，也同意兩岸航空公司可在其營運的航線上與同一方或對方具該航線營運權的航空公司進行購艙或共用班號等商業合作，提供旅客更多元彈性的航班選擇。此外，由於已確定松山—虹橋將比松山—羽田更早在松山機場營運，所以初期將以B757以下機型飛行，配合松山機場航廈調整工程完成日期，將可改以較大機型營運。
另外，民航局也表示將會在8月底前提出下次協商要求，希望在10月前展開談判，協商內容除包括加班、擴增新航點外，也將把春節加班機併入檢討，希望明年春節不會再發生台商來不及訂位或是票價過高的情形。
台籍航空公司松山—虹橋航班時間
據了解，目前華航爭取到了6╱14台北松山機場飛往虹橋的首班機，航班編號為CI201╱202，預計首班機去回程起降時間為0845╱1030、1145╱1330。此外，6╱15～10╱30的飛行時間為1215╱1400、1745╱1930，飛行日為每週一、二、三、四、六、日，使用B738客機。長榮方面，航班編號BR772╱771，去回程起降時間為1345╱1535、1950╱2145，飛行日為每週一、三、四、五、六、日，使用MD90客機。復興航空的航班編號為GE338╱337，去回程起降時間為0745╱0815、1030╱1200，飛行日為每週一、三，使用客機。（以上航班時間仍以航空公司最新公佈為主）